Biologisk denitrifikation

 
5CH6O + 4NO3-  »   5CO2 + 3H2O + 2N2  + 4OH-

 
Vid ofullständig denitrifikation reduceras inte kvävet helt och blir kvävgas utan istället kan slutprodukten bli nitrit eller lustgas. En ofullständig denitrifikation förekommer bl a då pH- värdet är lågt (pH 4-5), om temperaturen är låg och om miljön innehåller mycket låga halter av syre (Tonderski et al red, 2002).
 
Förutsättningen för att denitrifikation ska äga rum är att det råder syrebrist samtidigt som det finns nitrat och organiskt material att tillgå. Denitrifikationen är oftast minst på rent handelsgödslad jord och störst på lerjord där man spridit stallgödsel.
 
Enligt danska Landbrugets rådgivningscenter (1998) är det i så kallade "hot spots" i marken som denitrifikationen äger rum. Det innebär att denitrifikationen bara äger rum i en liten del av jordvolymen. Dessa "hot spots" är ofta vattenfyllda jordpartiklar där syre inte förmår tränga in, se figur 1. Finns det då också nitrat och organiskt material närvarande så kan denitrifikationen pågå så länge nitratet inte förbrukats. Om jorden torkar upp så att syre kan tränga in i jordklumpen upphör denitrifikationen.